RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 VN1R1Q9GZP7 353 aa22.93■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC28A2O43868 658 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 CT62P0C5K7 136 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 NSDHLQ15738 373 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 BBS10Q8TAM1 723 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 LZICQ8WZA0 190 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 C16orf58Q96GQ5 468 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 PYURFQ96I23 114 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF607Q96SK3 696 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 WDR54Q9H977 334 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 DUSP22Q9NRW4 184 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 NUP210LQ5VU65 1888 aa22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 SUV39H1O43463 412 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 CBX7O95931 251 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 AK1P00568 194 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 ALOX5P09917 674 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 SOX18P35713 384 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 FUT7Q11130 342 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 DHRS13Q6UX07 377 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 KRT73Q86Y46 540 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 DEFB124Q8NES8 71 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 OR52R1Q8NGF1 315 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 OR14A16Q8NHC5 309 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 RASSF5Q8WWW0 418 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC47A1Q96FL8 570 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 YIPF4Q9BSR8 244 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 PIGUQ9H490 435 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 BCL2L10Q9HD36 194 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 PRODH2Q9UF12 536 aa22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 C17orf105B2RV13 164 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 C9J4A7 227 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 PRKD3O94806 890 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF682O95780 498 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 CD63P08962 238 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 GCKP35557 465 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 SESN3P58005 492 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 HPCAP84074 193 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 HES3Q5TGS1 186 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 C16orf62Q7Z3J2 963 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 TSLPQ969D9 159 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 SEPHS2Q99611 448 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 CNPPD1Q9BV87 410 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 BTBD2Q9BX70 525 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 VCX3BQ9H321 246 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRA2Q9H9E1 313 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 CFL2Q9Y281 166 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 PLD2O14939 933 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 SERPINB7O75635 380 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 DKK1O94907 266 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 PGM3O95394 542 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 RECKO95980 971 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 HEXBP07686 556 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 S1PR1P21453 382 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 FASP25445 335 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 AQP1P29972 269 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 NKG7Q16617 165 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 CYBRD1Q53TN4 286 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM151BQ8IW70 566 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC9A6Q92581 669 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 FBXL20Q96IG2 436 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 SATB2Q9UPW6 733 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 V9GYQ6 96 aa22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3-201ENST00000379215 A0A0G2JPF8 293 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 PGDP52209 483 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM164Q5U3C3 297 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 ENPP6Q6UWR7 440 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 METTL21AQ8WXB1 218 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 CHID1Q9BWS9 393 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 PISDQ9UG56 409 aa22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3-201ENST00000379215 ERVK-19Q9WJR5 959 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms