RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 GJD3Q8N144 294 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 RAB42Q8N4Z0 105 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 AMER3Q8N944 861 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 NR4A3Q92570 626 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 UFD1Q92890 307 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 UCN3Q969E3 161 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 DIRAS2Q96HU8 199 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC3BQ96PB8 259 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 BBS4Q96RK4 519 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 C17orf62Q9BQA9 187 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 PINK1Q9BXM7 581 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRA2Q9H9E1 313 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0G2JPF8 293 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 TMCC2O75069 709 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 UBXN7O94888 489 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 CSF3P09919 207 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 CLEC2LP0C7M8 214 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 GABRA5P31644 462 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 SDC2P34741 201 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 MAN2A2P49641 1150 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 RPS25P62851 125 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM35AQ53FP2 167 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 TTLQ8NG68 377 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 TM9SF4Q92544 642 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 CAMK1GQ96NX5 476 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 SLC38A2Q96QD8 506 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0G2JN53 185 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 CENPXA8MT69 81 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 MAN2B1O00754 1011 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 SERPIND1P05546 499 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 ACRP10323 421 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 MTNR1AP48039 350 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 CDK3Q00526 305 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 GPR19Q15760 415 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 TBRG1Q3YBR2 411 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 OR2G6Q5TZ20 316 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 OLIG3Q7RTU3 272 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 ADCK2Q7Z695 626 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 LINC01555Q8NAE3 123 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 PSD4Q8NDX1 1056 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 KATNB1Q9BVA0 655 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 EGLN3Q9H6Z9 239 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 TM7SF3Q9NS93 570 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 CKAP5Q14008 2032 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 LRIT2A6NDA9 550 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 TFECO14948 347 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 ITGB8P26012 769 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 DAB2P98082 770 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF793Q6ZN11 406 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 RDH10Q8IZV5 341 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 VWA5B2Q8N398 1253 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 MOAP1Q96BY2 351 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 SAP130Q9H0E3 1048 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 RERGLQ9H628 205 aa17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 SYT5O00445 386 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 PCCBP05166 539 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 P2RY2P41231 377 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 TAS2R41P59536 307 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 SLAMF1Q13291 335 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF628Q5EBL2 1059 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 PPP2R2DQ66LE6 453 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF730Q6ZMV8 503 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 OR56A1Q8NGH5 318 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 SLC9A6Q92581 669 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 RAB7BQ96AH8 199 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 MMP28Q9H239 520 aa17.16■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 A0A087WUU8 490 aa17.15■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 FAM170BA6NMN3 283 aa17.15■□□□□ 0.34
SPNS3-201ENST00000355530 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms