RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 PROM1O43490 865 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 LAMP2P13473 410 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 SELPP16109 830 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 RFX2P48378 723 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 CLCNKAP51800 687 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 WDR5P61964 334 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF750Q32MQ0 723 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 OR4N5Q8IXE1 308 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF558Q96NG5 402 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 SLC28A3Q9HAS3 691 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 IRAK3Q9Y616 596 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 A0A075B6Q4 140 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 HYKKA2RU49 373 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 QSOX1O00391 747 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 IFNA7P01567 189 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 VIPR1P32241 457 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 B4GALNT1Q00973 533 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 RHAGQ02094 409 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 BTN1A1Q13410 526 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 NDUFAF6Q330K2 333 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 FAM27D1Q5T7N8 215 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 GALNT11Q8NCW6 608 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 OR5AR1Q8NGP9 310 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 MCHR1Q99705 422 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 NRTNQ99748 197 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 KATNB1Q9BVA0 655 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 SLAMF7Q9NQ25 335 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 PLATP00750 562 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 MT-ND4P03905 459 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ALPPP05187 535 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 C1SP09871 688 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 GRPRP30550 384 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 HSF2Q03933 536 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 GALNT6Q8NCL4 622 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 CHAC2Q8WUX2 184 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 STOML2Q9UJZ1 356 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 BAIAP2Q9UQB8 552 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 TBC1D3BA6NDS4 549 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 FAM86C2PA6NEL3 165 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 FAM25EA8MYX2 175 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ACP5P13686 325 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 CCR6P51684 374 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 LIM2P55344 173 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 MORN1Q5T089 497 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 MEDAGQ5VYS4 303 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 NUDT13Q86X67 352 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 SLC38A6Q8IZM9 456 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 SAMD8Q96LT4 415 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 OR4K3Q96R72 315 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 DMRT3Q9NQL9 472 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 A3GALT2U3KPV4 340 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 SHC1P29353 583 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 RPS5P46782 204 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 FAM46CQ5VWP2 391 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 OR8K5Q8NH50 307 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 C1orf216Q8TAB5 229 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 L7N2F9 121 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 RASGRP1O95267 797 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 NTN1O95631 604 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 IL1AP01583 271 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 F11P03951 625 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 CSN2P05814 226 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 MPC1LP0DKB6 136 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ARAFP10398 606 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 TYRP14679 529 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 DDCP20711 480 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 MMP11P24347 488 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 XCR1P46094 333 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 SOX2P48431 317 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 SP140Q13342 867 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 POMZP3Q6PJE2 187 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF767PQ75MW2 155 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 KIAA1958Q8N8K9 716 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 OR6T1Q8NGN1 323 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRN-201ENST00000295718 CREB3L4Q8TEY5 395 aa13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms