RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 FBXL18Q96ME1 805 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 C3P01024 1663 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CCDC58Q4VC31 144 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 GATSQ8NAP1 163 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SFXN5Q8TD22 340 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CDC6Q99741 560 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MTG2Q9H4K7 406 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CELP19835 753 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SPANXN4Q5MJ08 99 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 FAM156AQ8NDB6 213 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 BIRC7Q96CA5 298 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MOGQ16653 247 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MAP3K3Q99759 626 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ENKD1Q9H0I2 346 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 RFPL1O75677 317 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ARG2P78540 354 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 OGDHQ02218 1023 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SGCZQ96LD1 299 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 FUOMA2VDF0 154 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 KCNK5O95279 499 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 C5AR1P21730 350 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 UPRTQ96BW1 309 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 C12orf42Q96LP6 360 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 KCNK13Q9HB14 408 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 RNF212BA8MTL3 300 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TULP2O00295 520 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 FOXN2P32314 431 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 APLNRP35414 380 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 KCNQ1P51787 676 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SRYQ05066 204 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ZNF529Q6P280 563 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SLIT2O94813 1529 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SLC34A2O95436 690 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 GARNL3Q5VVW2 1013 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 RNF128Q8TEB7 428 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SNX18Q96RF0 628 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 OR51F1A6NGY5 319 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 JUPP14923 745 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CAMLGP49069 296 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SHFQ7M4L6 423 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 IFNA17P01571 189 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TAS2R20P59543 309 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TBPL1P62380 186 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 C1orf74Q96LT6 269 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TMEM165Q9HC07 324 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ADORA3P0DMS8 318 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 GRPRP30550 384 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 DEFB119Q8N690 84 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 J3KR12 359 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SOX2P48431 317 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 A0A087WUU8 490 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SLC1A7O00341 560 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 KIAA0355O15063 1070 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CD79AP11912 226 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 RAB3AP20336 220 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 HK3P52790 923 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 WDR92Q96MX6 357 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 NELL2Q99435 816 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ARL6Q9H0F7 186 aa8.9□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms