RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	KLHL29	Q96CT2	875 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	XPR1	Q9UBH6	696 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ACOX3	O15254	700 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	PPM1B	O75688	479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	KRT38	O76015	456 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ACTL6A	O96019	429 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CLPS	P04118	112 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CT62	P0C5K7	136 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	NAGA	P17050	411 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	GPX3	P22352	226 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CTSS	P25774	331 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINB9	P50453	376 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC7A5	Q01650	507 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	KEAP1	Q14145	624 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	EIPR1	Q53HC9	387 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CDC20B	Q86Y33	519 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TMCO6	Q96DC7	493 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	NTMT1	Q9BV86	223 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SENP1	Q9P0U3	644 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM221A	A4D161	298 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CD8B2	A6NJW9	211 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	OR7A17	O14581	309 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	BMP7	P18075	431 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	KLK2	P20151	261 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	DCAF7	P61962	342 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	GUCY2D	Q02846	1103 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SRY	Q05066	204 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	VASN	Q6EMK4	673 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	METTL4	Q8N3J2	472 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	NAXE	Q8NCW5	288 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	UCN3	Q969E3	161 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	OMA1	Q96E52	524 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SH3GL2	Q99962	352 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ITPA	Q9BY32	194 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	PCTP	Q9UKL6	214 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CBLC	Q9ULV8	474 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	NFU1	Q9UMS0	254 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1W2PS29	197 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CASK	O14936	926 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	RAF1	P04049	648 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	EPX	P11678	715 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TAC1	P20366	129 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	PTPN6	P29350	595 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	IL12B	P29460	328 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF136	P52737	540 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	DIO3	P55073	304 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SORD	Q00796	357 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAF3	Q13114	568 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SNTA1	Q13424	505 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TRADD	Q15628	312 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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