RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SLC6A18	Q96N87	628 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	OPALIN	Q96PE5	141 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	NUAK2	Q9H093	628 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	NT5DC2	Q9H857	520 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	GDE1	Q9NZC3	331 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0C4DFX4	3053 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	COL4A3	Q01955	1670 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CTDSP2	O14595	271 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	PTN	P21246	168 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	C5AR1	P21730	350 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	PKLR	P30613	574 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	MC3R	P41968	323 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SLC15A1	P46059	708 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	HOXC5	Q00444	222 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF91	Q05481	1191 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	OR2L3	Q8NG85	312 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	KAT2A	Q92830	837 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	HPS1	Q92902	700 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	COL26A1	Q96A83	441 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TPK1	Q9H3S4	243 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ASB4	Q9Y574	426 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	RFXAP	O00287	272 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CS	O75390	466 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	GINS1	Q14691	196 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	UTS2B	Q765I0	119 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	FGF14	Q92915	247 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	HHATL	Q9HCP6	504 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	RGS5	O15539	181 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	DLGAP3	O95886	979 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	POU2F2	P09086	479 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	HOXD12	P35452	270 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SOX6	P35712	828 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	IGFALS	P35858	605 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	KHK	P50053	298 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SPHAR	Q15513	63 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	LTB4R	Q15722	352 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	KCT2	Q8NC54	265 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TTL	Q8NG68	377 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM80	Q96HE8	168 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD8	Q96I13	439 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	LRR1	Q96L50	414 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	FGF22	Q9HCT0	170 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	KDM1A	O60341	852 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	EML2	O95834	649 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ADH1B	P00325	375 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ASGR2	P07307	311 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TGM4	P49221	684 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN2	P57739	230 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	BTN3A2	P78410	334 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	DMPK	Q09013	629 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	MAP4K2	Q12851	820 aa		12.32	□□□□□ -0.44

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