RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.32□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.32□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.32□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 SPASTQ9UBP0 616 aa6.32□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.32□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ZFHX3Q15911 3703 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 AKAP9Q99996 3911 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 GSTA4O15217 222 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 EML2O95834 649 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 KRT6AP02538 564 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 KRT6BP04259 564 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ETFAP13804 333 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 MMP11P24347 488 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 RFX3P48380 749 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 KRT6CP48668 564 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 RGS4P49798 205 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 MC1RQ01726 317 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 SQSTM1Q13501 440 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF846Q147U1 533 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 COL21A1Q96P44 957 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 GDE1Q9NZC3 331 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 A0A0G2JMP0 313 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 A0A1W2PS29 197 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PLOD3O60568 738 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 WISP2O76076 250 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 IGFALSP35858 605 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 E2F1Q01094 437 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 OR52N1Q8NH53 320 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 MAL2Q969L2 176 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 MOAP1Q96BY2 351 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 MAP6Q96JE9 813 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PRRC1Q96M27 445 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 DPY30Q9C005 99 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 FN3KQ9H479 309 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 LYRM4Q9HD34 91 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ASB6Q9NWX5 421 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 CLDN25C9JDP6 229 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PLPP2O43688 288 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PRKYO43930 277 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 MPZL2O60487 215 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 TSPAN3O60637 253 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 C8AP07357 584 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 TYRP1P17643 537 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 GADD45AP24522 165 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 LTBRP36941 435 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 CD79BP40259 229 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ETV5P41161 510 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 BDKRB1P46663 353 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 SLC6A11P48066 632 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ETV1P50549 477 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 CRISP1P54107 249 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PLCL1Q15111 1095 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PLK5Q496M5 336 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 TREML4Q6UXN2 200 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 LINC00471Q8N535 108 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 SETD9Q8NE22 299 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.31□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 LDLRAD4O15165 306 aa6.3□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 ADAMDEC1O15204 470 aa6.3□□□□□ -1.4
PCAT5-201ENST00000626667 SSX4O60224 188 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms