RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 HBEGFQ99075 208 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 SPSB2Q99619 263 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PP18 115 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 C21orf140B9A014 251 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM227AF5H4B4 570 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 ERVH48-1M5A8F1 160 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 CDK2AP1O14519 115 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 DSCR3O14972 297 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 KERAO60938 352 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 STK16O75716 305 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 SNAP29O95721 258 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 GPIP06744 558 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 EPORP19235 508 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 FBLP22087 321 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 PMS2P3Q13401 168 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 RCAN2Q14206 197 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 TCTE1Q5JU00 501 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR107Q5VW38 600 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 LCTLQ6UWM7 567 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF843Q8N446 348 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1191Q96A73 305 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 PEX11GQ96HA9 241 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 CRB3Q9BUF7 120 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 AICDAQ9GZX7 198 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 CXorf21Q9HAI6 301 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 POLHQ9Y253 713 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNE2Q9Y6J6 123 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGEF1-209ENST00000607882 ATE1O95260 518 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 GRK3P35626 688 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 NUP107P57740 925 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM214AQ32MH5 1076 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 MRGPREQ86SM8 312 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ASPGQ86U10 573 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 DHRSXQ8N5I4 330 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 STAG3L4Q8TBR4 150 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ANAPC2Q9UJX6 822 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 GMEB1Q9Y692 573 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 TCRBV5S2A0A599 114 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CCNDBP1O95273 360 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.531e-6■■□□□ 14.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 GCGRP47871 477 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ABATP80404 500 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CHIT1Q13231 466 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 DOC2AQ14183 400 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB39AQ14964 217 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 NEDD8Q15843 81 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CYBRD1Q53TN4 286 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB46Q86UZ6 589 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 DTX3Q8N9I9 347 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 FDCSPQ8NFU4 85 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 FNDC8Q8TC99 324 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 DOK4Q8TEW6 326 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ATL1Q8WXF7 558 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR87Q9BY21 358 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKMY1Q9P2S6 941 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 C3orf18Q9UK00 162 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF225Q9UK10 706 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PPW3 197 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC154A6NI56 674 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 B4GALT2O60909 372 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 FCGR1AP12314 374 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CAPGP40121 348 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 XCR1P46094 333 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC6A12P48065 614 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CD97P48960 835 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 SYVN1Q86TM6 617 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2T11Q8NH01 316 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A8Q8TCC7 542 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 LRFN5Q96NI6 719 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 AIG1Q9NVV5 245 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CSAG2Q9Y5P2 127 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BMQ9 156 aa11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms