RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	DLGAP3	O95886	979 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	RECK	O95980	971 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PRB1	P04280	392 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	LIF	P15018	202 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	GPC1	P35052	558 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	BTG2	P78543	158 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	RHAG	Q02094	409 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	LIPE	Q05469	1076 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	DUSP2	Q05923	314 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	RBBP4	Q09028	425 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	MGAT2	Q10469	447 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	BNIP2	Q12982	314 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	HSPB3	Q12988	150 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NKG7	Q16617	165 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	GTDC1	Q4AE62	458 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ASB9	Q96DX5	294 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	WBP1	Q96G27	269 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	GIN1	Q9NXP7	522 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PADI1	Q9ULC6	663 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	TTC36	A6NLP5	189 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	UPK1A	O00322	258 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ACOT8	O14734	319 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PSMG1	O95456	288 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ITGB2	P05107	769 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF28	P17035	718 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SOX18	P35713	384 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	GSK3B	P49841	420 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	GAB1	Q13480	694 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	VEZF1	Q14119	521 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	FHL5	Q5TD97	284 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	HPS6	Q86YV9	775 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ESX1	Q8N693	406 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	TTC9	Q92623	222 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	RNF31	Q96EP0	1072 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	DGAT2	Q96PD7	388 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	POMP	Q9Y244	141 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392		A0A1W2PS29	197 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392		C9J4A7	227 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ASNA1	O43681	348 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	DYRK3	O43781	588 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	OR10H2	O60403	315 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	TNFRSF21	O75509	655 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	JRK	O75564	520 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	AGR2	O95994	175 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	S1PR1	P21453	382 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NT5E	P21589	574 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	MTPN	P58546	118 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	FUT7	Q11130	342 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	LY6D	Q14210	128 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SELPLG	Q14242	412 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NSDHL	Q15738	373 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PCSK4	Q6UW60	755 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM205	Q6UW68	189 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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