RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	GHDC	Q8N2G8	530 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	FAM13C	Q8NE31	585 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ERP27	Q96DN0	273 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	FCRL1	Q96LA6	429 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CCT7	Q99832	543 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PRODH2	Q9UF12	536 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PINLYP	A6NC86	204 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	HS6ST1	O60243	411 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	HSPA4L	O95757	839 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TACR1	P25103	407 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	NTS	P30990	170 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	SOX18	P35713	384 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	DUSP8	Q13202	625 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	NTRK2	Q16620	822 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	GALNTL6	Q49A17	601 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ITPA	Q9BY32	194 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM114	B3SHH9	223 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	SLC19A2	O60779	497 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	LDLR	P01130	860 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	RNF224	P0DH78	156 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	SDC1	P18827	310 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CASP6	P55212	293 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ESPL1	Q14674	2120 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM64	Q6YI46	380 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	KAT2A	Q92830	837 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	RELT	Q969Z4	430 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	EGLN2	Q96KS0	407 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CNIH4	Q9P003	139 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TP53I11	O14683	189 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PIGA	P37287	484 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	DNASE1L1	P49184	302 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	EMD	P50402	254 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	DCAF7	P61962	342 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	MPP2	Q14168	576 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	RPS6KA2	Q15349	733 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	NNAT	Q16517	81 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	XKR7	Q5GH72	579 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	FJX1	Q86VR8	437 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	TSSK3	Q96PN8	268 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	WIPF3	A6NGB9	483 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	FAM166B	A8MTA8	275 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ACOX3	O15254	700 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ITM2A	O43736	263 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	PLOD3	O60568	738 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	SLITRK5	O94991	958 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ABO	P16442	354 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	GRK2	P25098	689 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	MAPK1	P28482	360 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CA7	P43166	264 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	FBXW4	P57775	412 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	KCNJ2	P63252	427 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	HSF1	Q00613	529 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PSME3-209	ENST00000589469	CES4A	Q5XG92	561 aa		18.46	■□□□□ 0.55

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