RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPHAR	Q15513	63 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MCM10	Q7L590	875 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF410	Q86VK4	478 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NLRP14	Q86W24	1093 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCNMB4	Q86W47	210 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MGARP	Q8TDB4	240 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	HAS2	Q92819	552 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PKP2	Q99959	881 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	OR1A2	Q9Y585	309 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NAIP	Q13075	1403 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PSMD3	O43242	534 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TNFSF12	O43508	249 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	HSF2BP	O75031	334 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NXPH4	O95158	308 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANGPTL1	O95841	491 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	HPR	P00739	348 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPO	P01588	193 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MT-ND3	P03897	115 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	B4GALT1	P15291	398 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SELE	P16581	610 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	EDNRA	P25101	427 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ALDH3B1	P43353	468 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CD300C	Q08708	224 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDE7A	Q13946	482 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRT31	Q15323	416 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	STX1A	Q16623	288 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	C1orf189	Q5VU69	101 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	METTL7B	Q6UX53	244 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	C17orf64	Q86WR6	236 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM131B	Q86XD5	332 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SFRP1	Q8N474	314 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARL10	Q8N8L6	244 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPATCH11	Q8N954	259 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRPV3	Q8NET8	790 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRRC15	Q8TF66	581 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LIPH	Q8WWY8	451 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CXorf58	Q96LI9	332 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF597	Q96LX8	424 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	S1PR3	Q99500	378 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SSX3	Q99909	188 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABCG4	Q9H172	646 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	THAP9	Q9H5L6	903 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SP140L	Q9H930	580 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	WDR41	Q9HAD4	459 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PAK5	Q9P286	719 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	IL19	Q9UHD0	177 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		2.53	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2

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