RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 TMEM81Q6P7N7 255 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-206ENST00000588345 IFT81Q8WYA0 676 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-206ENST00000588345 TM4SF18Q96CE8 201 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-206ENST00000588345 CTHRC1Q96CG8 243 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-206ENST00000588345 TMEM41AQ96HV5 264 aa16.74■□□□□ 0.27
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CTIF-206ENST00000588345 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
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CTIF-206ENST00000588345 CFL2Q9Y281 166 aa16.74■□□□□ 0.27
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CTIF-206ENST00000588345 C15orf41Q9Y2V0 281 aa16.74■□□□□ 0.27
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CTIF-206ENST00000588345 FAM219BQ5XKK7 198 aa16.71■□□□□ 0.27
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CTIF-206ENST00000588345 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
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CTIF-206ENST00000588345 TMEM216Q9P0N5 145 aa16.71■□□□□ 0.27
CTIF-206ENST00000588345 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.71■□□□□ 0.27
CTIF-206ENST00000588345 MCM8Q9UJA3 840 aa16.71■□□□□ 0.27
CTIF-206ENST00000588345 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
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CTIF-206ENST00000588345 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 MANBAO00462 879 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ACOX3O15254 700 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 RHOXF2BP0C7M4 288 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 TAC1P20366 129 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 PTGDSP41222 190 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 RIPPLY3P57055 190 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 DCAF7P61962 342 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
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