RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 GINS1Q14691 196 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PCM1Q15154 2024 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SNAPC1Q16533 368 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CARTPTQ16568 116 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF385BQ569K4 471 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC22A10Q63ZE4 541 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 C22orf42Q6IC83 251 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CNIH2Q6PI25 160 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM107Q6UX40 140 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATC1Q76KD6 591 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RRM2BQ7LG56 351 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 C17orf64Q86WR6 236 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 VRK3Q8IV63 474 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 YIPF7Q8N8F6 280 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX19Q8NA77 164 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR156Q8NFN8 814 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4K5Q8NGD3 323 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PIGXQ8TBF5 258 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF480Q8WV37 535 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RFT1Q96AA3 541 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RGMAQ96B86 450 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 IGSF21Q96ID5 467 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 LMLNQ96KR4 655 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35G5Q96KT7 338 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 C12orf10Q9HB07 376 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MCUBQ9NWR8 336 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MARK1Q9P0L2 795 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SRRDQ9UH36 339 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ALG5Q9Y673 324 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GW55 424 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DUXAA6NLW8 204 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 HEPACAM2A8MVW5 462 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 K7ERQ8 282 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 FFAR1O14842 300 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRTM2O43300 516 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPAN6O43657 245 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ETHE1O95571 254 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 B3GALT4O96024 378 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SERPIND1P05546 499 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CD1AP06126 327 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CKMP06732 381 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 IL3P08700 152 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM157BP0CG42 384 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 NR2F1P10589 423 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ERGP11308 486 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 POU2F1P14859 743 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MAGP20916 626 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PRKAR1BP31321 381 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MMP12P39900 470 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC1A3P43003 542 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 LIM2P55344 173 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 AP3S2P59780 193 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ACTC1P68032 377 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ACTA1P68133 377 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR5P85299 388 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CD83Q01151 205 aa7.3□□□□□ -1.24
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