RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	GAB1	Q13480	694 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	SETDB1	Q15047	1291 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	ACKR1	Q16570	336 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PRR22	Q8IZ63	422 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	UCN3	Q969E3	161 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	CENPK	Q9BS16	269 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	CR1	P17927	2039 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169		A0A1W2PS29	197 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM64B	A6NI03	449 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169		E7ESA3	106 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169		H0Y3Z8	333 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169		K7EPI3	171 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	MSTN	O14793	375 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	TP73	O15350	636 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PPM1B	O75688	479 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	TNFSF13	O75888	250 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PIAS1	O75925	651 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	AIFM1	O95831	613 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	CT62	P0C5K7	136 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	FPR1	P21462	350 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	CHM	P24386	653 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	GCK	P35557	465 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PTGDS	P41222	190 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	DIO3	P55073	304 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PPP2R2B	Q00005	443 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	SRY	Q05066	204 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	CBLB	Q13191	982 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	EXT2	Q93063	718 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	GPR22	Q99680	433 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	OR10A5	Q9H207	317 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	WDR41	Q9HAD4	459 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	OPTC	Q9UBM4	332 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	RNF112	Q9ULX5	631 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-238	ENST00000568169	PGRMC2	O15173	223 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ICOSLG	O75144	302 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CBR3	O75828	277 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	STMN1	P16949	149 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	KRT15	P19012	456 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	S1PR1	P21453	382 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	GPX3	P22352	226 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CRYGS	P22914	178 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	MC3R	P41968	323 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	GFRA1	P56159	465 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	FAM27E3	Q08E93	113 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	SNTA1	Q13424	505 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CUL3	Q13618	768 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	DESI1	Q6ICB0	168 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ISCA2	Q86U28	154 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		10.33	□□□□□ -0.76

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