RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASPDHA6ND91 283 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDPK1O15530 556 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AKAP10O43572 662 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPX3P22352 226 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EMX2Q04743 252 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSD4Q8NDX1 1056 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR52R1Q8NGF1 315 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADIPOR1Q96A54 375 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP1R36Q96LQ0 422 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUF2Q9BZD4 464 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MEAF6Q9HAF1 191 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OLAHQ9NV23 265 aa20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLCO1B7G3V0H7 640 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLOD3O60568 738 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFI6P09912 130 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP2R2AP63151 447 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DUSP8Q13202 625 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LYPD8Q6UX82 237 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MDGA2Q7Z553 956 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZFP28Q8NHY6 868 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NR4A3Q92570 626 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KAT2AQ92830 837 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AMDHD1Q96NU7 426 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLX1AQ9BQ83 275 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GLIPR2Q9H4G4 154 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SH3BP4Q9P0V3 963 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.49■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A087WV62 115 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HDAC3O15379 428 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FBXO45P0C2W1 286 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NRG3P56975 720 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCAF7P61962 342 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PMP22Q01453 160 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTGR1Q14914 329 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF385BQ569K4 471 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FRMD6Q96NE9 622 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITPAQ9BY32 194 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DTX4Q9Y2E6 619 aa20.48■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRPC5OSA6NMA1 111 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CAPN14A8MX76 684 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLOD2O00469 737 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COQ9O75208 318 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 G6PDP11413 515 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EDN3P14138 238 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRPS1L1P21108 318 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MC3RP41968 323 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FRKP42685 505 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EMDP50402 254 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FHL5Q5TD97 284 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SIMC1Q8NDZ2 872 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR7G2Q8NG99 324 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DYDC1Q8WWB3 177 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAPRE3Q9UPY8 281 aa20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FASNP49327 2511 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACOX3O15254 700 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PEX1O43933 1283 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LBPP18428 481 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPICP45877 212 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C21orf58P58505 322 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OGFOD2Q6N063 350 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM107Q6UX40 140 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SULF2Q8IWU5 870 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NATD1Q8N6N6 113 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSPBAP1Q96EW2 488 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAS2R9Q9NYW1 312 aa20.46■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SDHDO14521 159 aa20.45■□□□□ 0.86
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CBX6O95503 412 aa20.45■□□□□ 0.86
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KITP10721 976 aa20.45■□□□□ 0.86
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DRD5P21918 477 aa20.45■□□□□ 0.86
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GNLYP22749 145 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms