RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 IL1RL2Q9HB29 575 aa8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SAR1AQ9NR31 198 aa8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 LANCL2Q9NS86 450 aa8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 DEPPQ9NTK1 212 aa8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 WWOXQ9NZC7 414 aa8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 OPTCQ9UBM4 332 aa8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF225Q9UK10 706 aa8.58□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.58□□□□□ -1.04
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SMAD3-215ENST00000560424 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SERTM1A2A2V5 107 aa8.57□□□□□ -1.04
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SMAD3-215ENST00000560424 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.57□□□□□ -1.04
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SMAD3-215ENST00000560424 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
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SMAD3-215ENST00000560424 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 P04436 131 aa8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 KITP10721 976 aa8.57□□□□□ -1.04
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SMAD3-215ENST00000560424 CCND1P24385 295 aa8.57□□□□□ -1.04
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SMAD3-215ENST00000560424 KRT72Q14CN4 511 aa8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 QSOX2Q6ZRP7 698 aa8.57□□□□□ -1.04
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SMAD3-215ENST00000560424 IPPKQ9H8X2 491 aa8.57□□□□□ -1.04
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SMAD3-215ENST00000560424 MID1IP1Q9NPA3 183 aa8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM184CQ9NVA4 438 aa8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 HEY2Q9UBP5 337 aa8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.57□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SH3D21A4FU49 640 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 GOLGA8OA6NCC3 632 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ERICH4A6NGS2 130 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CAPN14A8MX76 684 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PPP6CO00743 305 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CLDN4O14493 209 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SDHDO14521 159 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 OR2J2O76002 312 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ZFAND5O76080 213 aa8.56□□□□□ -1.04
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SMAD3-215ENST00000560424 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SLC16A8O95907 504 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CHEK2O96017 543 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SERPIND1P05546 499 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 MAOAP21397 527 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 IMPA1P29218 277 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CPA2P48052 419 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 HSPA7P48741 367 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 OLR1P78380 273 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 BTG2P78543 158 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 BTKQ06187 659 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SMU1Q2TAY7 513 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 XKR7Q5GH72 579 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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