RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 SNX15Q9NRS6 342 aa7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 WWOXQ9NZC7 414 aa7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 DKKL1Q9UK85 242 aa7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 SNX24Q9Y343 169 aa7.31□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 GLOD5A6NK44 160 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 OR6C76A6NM76 312 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 HS3ST1O14792 307 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 RAD51CO43502 376 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 TGM6O95932 706 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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PCNX1-215ENST00000557428 EPB42P16452 691 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 IVDP26440 423 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 CNTFP26441 200 aa7.3□□□□□ -1.24
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PCNX1-215ENST00000557428 IDUAP35475 653 aa7.3□□□□□ -1.24
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PCNX1-215ENST00000557428 CDKN1AP38936 164 aa7.3□□□□□ -1.24
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PCNX1-215ENST00000557428 RAP1GDS1P52306 607 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 SLC37A1P57057 533 aa7.3□□□□□ -1.24
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PCNX1-215ENST00000557428 PCDH1Q08174 1060 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 FAPQ12884 760 aa7.3□□□□□ -1.24
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PCNX1-215ENST00000557428 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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PCNX1-215ENST00000557428 CRYMQ14894 314 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 MORF4L2Q15014 288 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 BEX5Q5H9J7 111 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 C18orf63Q68DL7 685 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 FAM45BPQ6NSW5 357 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 C8orf74Q6P047 294 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.3□□□□□ -1.24
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PCNX1-215ENST00000557428 FAM45AQ8TCE6 357 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
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PCNX1-215ENST00000557428 SFXN2Q96NB2 322 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 BEX2Q9BXY8 128 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 RAB17Q9H0T7 212 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 ACTR8Q9H981 624 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 EHD3Q9NZN3 535 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 ROS1P08922 2347 aa7.3□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 SLC22A20A6NK97 555 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 CLOCKO15516 846 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 ADAM11O75078 769 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 BANF1O75531 89 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 SOX30O94993 753 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 TGFB1P01137 390 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 AHSGP02765 367 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 CHMP24386 653 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 DPP4P27487 766 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 GABRB3P28472 473 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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PCNX1-215ENST00000557428 LHX2P50458 406 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 NEK2P51955 445 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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PCNX1-215ENST00000557428 CAV1Q03135 178 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 DOC2AQ14183 400 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 ARMC3Q5W041 872 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX1-215ENST00000557428 OR2A2Q6IF42 318 aa7.29□□□□□ -1.24
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