RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF114	Q8NC26	417 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2T12	Q8NG77	320 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OR52J3	Q8NH60	311 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RAET1E	Q8TD07	263 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	STARD8	Q92502	1023 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SCMH1	Q96GD3	660 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LMLN	Q96KR4	655 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TESK2	Q96S53	571 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MED20	Q9H944	212 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNK13	Q9HB14	408 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	S100A14	Q9HCY8	104 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	POLK	Q9UBT6	870 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MIOX	Q9UGB7	285 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MYO6	Q9UM54	1294 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CEP152	O94986	1710 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ERVK-7	P63135	1459 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PN81	502 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF222	A6NCQ9	220 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	IFITM10	A6NMD0	228 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	WASH3P	C4AMC7	463 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CFLAR	O15519	480 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	XPNPEP2	O43895	674 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJB6	O75190	326 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NDUFA7	O95182	113 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MSH3	P20585	1137 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PCMT1	P22061	227 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RFC4	P35249	363 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CHRNA7	P36544	502 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CAPG	P40121	348 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GRIA1	P42261	906 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MATK	P42679	507 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MYL7	Q01449	175 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MECOM	Q03112	1051 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SRY	Q05066	204 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LGALS3BP	Q08380	585 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CNTN1	Q12860	1018 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OR1C1	Q15619	314 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SSX2	Q16385	188 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HKDC1	Q2TB90	917 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	XKR3	Q5GH77	459 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DDI2	Q5TDH0	399 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM225	Q6GV28	225 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ASRGL1	Q7L266	308 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SFR1	Q86XK3	245 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PLD3	Q8IV08	490 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR49	Q8IV35	697 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKFN1	Q8N957	763 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TMED6	Q8WW62	240 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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