RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PGGT1B	P53609	377 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	DIO3	P55073	304 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TAGAP	Q8N103	731 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MCU	Q8NE86	351 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNC2	Q96PR1	638 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT12	Q99456	494 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ATR	Q13535	2644 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPN14	A8MX76	684 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC175	P0C221	793 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PGAM1	P18669	254 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	GDF5	P43026	501 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	STT3A	P46977	705 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	HNMT	P50135	292 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PLIN5	Q00G26	463 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYM	Q14894	314 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SBSN	Q6UWP8	590 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	DOK4	Q8TEW6	326 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	F2RL3	Q96RI0	385 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CALHM2	Q9HA72	323 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	LYRM4	Q9HD34	91 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	VWA7	Q9Y334	891 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	9.88	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511		H0Y3Z8	333 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC7	O00311	574 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF17	O60258	216 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10H2	O60403	315 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3BGRL	O75368	114 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX4	O95219	450 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	AHSG	P02765	367 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	C8B	P07358	591 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRB3	P28472	473 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SSR2	P43308	183 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF75D	P51815	510 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	HERVK_113	P63132	956 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK-8	P63133	956 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SRY	Q05066	204 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXF2	Q12947	444 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ACKR1	Q16570	336 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	EIPR1	Q53HC9	387 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	VASN	Q6EMK4	673 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX31	Q8N9S9	440 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL20	Q96IG2	436 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	RILP	Q96NA2	401 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	GNRHR2	Q96P88	292 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	NT5DC2	Q9H857	520 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PROK2	Q9HC23	129 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	WWOX	Q9NZC7	414 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	JKAMP	Q9P055	326 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		9.87	□□□□□ -0.83

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