RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TTC34	A8MYJ7	566 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	STK25	O00506	426 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CD3G	P09693	182 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FSHR	P23945	695 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TACR1	P25103	407 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GPR4	P46093	362 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TAP2	Q03519	686 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	LRRC32	Q14392	662 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR7G3	Q8NG95	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1B0GVC2	190 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1B0GVT2	93 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574		A6NIN4	97 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574		H3BSH0	61 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	WRB	O00258	174 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GJB5	O95377	273 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SCG5	P05408	212 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CTSE	P14091	401 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF823	P16415	610 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NPR2	P20594	1047 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TBPL1	P62380	186 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ARFRP1	Q13795	201 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ULK3	Q6PHR2	472 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NUS1	Q96E22	293 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574		E7EQ34	232 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NDUFS4	O43181	175 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	EPHX1	P07099	455 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NUDT7	P0C024	238 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ARNT	P27540	789 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PPM1A	P35813	382 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	HTR3A	P46098	478 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CAP1	Q01518	475 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ODF4	Q2M2E3	257 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR8K3	Q8NH51	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	LMLN	Q96KR4	655 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	IL26	Q9NPH9	171 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR6C74	A6NCV1	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SELP	P16109	830 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	AHCY	P23526	432 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CLCNKA	P51800	687 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CAV3	P56539	151 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574		A0A0U1RQS6	177 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574		H7BY64	318 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PSMD9	O00233	223 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SLC43A1	O75387	559 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SPDEF	O95238	335 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GSR	P00390	522 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FLT3LG	P49771	235 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	IER5L	Q5T953	404 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	KCT2	Q8NC54	265 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574		A0A0G2JMP0	313 aa		13.46	□□□□□ -0.26

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