RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	HEY2	Q9UBP5	337 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	VWA7	Q9Y334	891 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	OARD1	Q9Y530	152 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	GPRIN2	O60269	458 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PRAMEF4	O60810	478 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	ADAM11	O75078	769 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	ICOSLG	O75144	302 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PPM1B	O75688	479 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	GPR75	O95800	540 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV4-39	P01824	125 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	ABCD3	P28288	659 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	SSTR4	P31391	388 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PTGDS	P41222	190 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	VPS41	P49754	854 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	SLAMF1	Q13291	335 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	LAPTM5	Q13571	262 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	BCL2A1	Q16548	175 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	C18orf63	Q68DL7	685 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	GPR180	Q86V85	440 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PRR22	Q8IZ63	422 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	RDH11	Q8TC12	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PHF11	Q9UIL8	331 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PROCR	Q9UNN8	238 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	C2orf72	A6NCS6	295 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	DANCR	P0C864	163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	CD22	P20273	847 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	SRD5A2	P31213	254 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	CDKN1A	P38936	164 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	DOC2A	Q14183	400 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	CRYM	Q14894	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	HGD	Q93099	445 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	FBXW5	Q969U6	566 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	SFXN2	Q96NB2	322 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	NODAL	Q96S42	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	LIPT1	Q9Y234	373 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A096LNT2	108 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	SOD3	P08294	240 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC35E2	P0CK97	266 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PGAM1	P18669	254 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	CASP2	P42575	452 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	OR10A5	Q9H207	317 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	RNF122	Q9H9V4	155 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	TGFB1	P01137	390 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PEPD	P12955	493 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	GGT5	P36269	586 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	VLDLR	P98155	873 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	GUSBP1	Q15486	140 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SHOC2-205	ENST00000489390	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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