RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473722.5

SCIN-205, Transcript of scinderin, human

TSL 4

Gene SCIN, Length 656 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCIN-205	ENST00000473722	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	AGT	P01019	485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	IL1B	P01584	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DNTT	P04053	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ACADM	P11310	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PSMA3	P25788	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RGR	P47804	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SERPINB9	P50453	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CLDN20	P56880	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DCDC1	P59894	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ACVR1	Q04771	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CDC16	Q13042	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CST6	Q15828	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	KYNU	Q16719	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722		Q6ZTC4	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CERS2	Q96G23	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NODAL	Q96S42	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	EPYC	Q99645	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CPNE1	Q99829	537 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TREX1	Q9NSU2	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	VPS18	Q9P253	973 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722		A0A1W2PS18	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MAP2K7	O14733	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SCAMP1	O15126	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF217	O75362	1048 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	AVIL	O75366	819 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RALB	P11234	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ADRB3	P13945	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	UGT1A1	P22309	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NUDT1	P36639	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SPAM1	P38567	509 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MMP12	P39900	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GP5	P40197	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GRIA1	P42261	906 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MSH2	P43246	934 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PSMD8	P48556	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TTPA	P49638	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NUMB	P49757	651 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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