RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472000.1

REV1-208, Transcript of REV1, DNA directed polymerase, human

TSL 2

Gene REV1, Length 778 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REV1-208	ENST00000472000	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	PDIA5	Q14554	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000		Q8NFD4	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	TSG101	Q99816	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	COA1	Q9GZY4	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	ABCB11	O95342	1321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000		A0A087WV48	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	PDHX	O00330	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	ZBTB5	O15062	677 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	OGT	O15294	1046 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	TNFSF12	O43508	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	SI	P14410	1827 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	PSMB4	P28070	264 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	AFF2	P51816	1311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	RLF	Q13129	1914 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	SPA17	Q15506	151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1-208	ENST00000472000	ANK1	P16157	1881 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	MLNR	O43193	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	TIMM44	O43615	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	BUB1	O43683	1085 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	RSPH10B	P0C881	870 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	LBP	P18428	481 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	SRPX	P78539	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	TCP10	Q12799	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	GIT2	Q14161	759 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1-208	ENST00000472000	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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