RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 GRHL2Q6ISB3 625 aa16.88■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 REEP3Q6NUK4 255 aa16.88■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 CHST9Q7L1S5 443 aa16.88■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ABCG4Q9H172 646 aa16.88■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 SCN8AQ9UQD0 1980 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 TPOP07202 933 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 HOXD10P28358 340 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 CLCNKAP51800 687 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 IQCHQ86VS3 1027 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 FAM26EQ8N5C1 309 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 HSD17B8Q92506 261 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 SLC6A16Q9GZN6 736 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 PIGUQ9H490 435 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 H0YIV9 168 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 STK25O00506 426 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 GABRPO00591 440 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 SGTAO43765 313 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 GABRA5P31644 462 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 DGKGP49619 791 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 AP1S1P61966 158 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 PLA1AQ53H76 456 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ZBTB44Q8NCP5 570 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 C16orf78Q8WTQ4 265 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 OR51B4Q9Y5P0 310 aa16.87■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ARRDC5A6NEK1 342 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 BTN1A1Q13410 526 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 MTFR2Q6P444 385 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 TMEM107Q6UX40 140 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 AIFM2Q9BRQ8 373 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 AUP1Q9Y679 476 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 AGAP14A8MT82 685 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 SGK494L7N484 410 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 IL3P08700 152 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 HSD3B1P14060 373 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 PTNP21246 168 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 BTCP35070 178 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ADAM15Q13444 863 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 SPIN4Q56A73 249 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 LDLRAD1Q5T700 205 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ZNF740Q8NDX6 193 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 GULP1Q9UBP9 304 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 HTTP42858 3142 aa16.86■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 PTGER1P34995 402 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 SLC6A11P48066 632 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 DCDC1P59894 354 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ANGPT1Q15389 498 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 GPR139Q6DWJ6 353 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 GPR135Q8IZ08 494 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 RAET1EQ8TD07 263 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 MARVELD3Q96A59 401 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 RBP7Q96R05 134 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 SLC22A12Q96S37 553 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 TEX46H3BTG2 121 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 FAAHO00519 579 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 STOMP27105 288 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 MAP2K6P52564 334 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 GPR17Q13304 367 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 LIPIQ6XZB0 460 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ALG14Q96F25 216 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 FERD3LQ96RJ6 166 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 GHITMQ9H3K2 345 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 IL20RAQ9UHF4 553 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 DOCK6Q96HP0 2047 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 ANHXE9PGG2 379 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 AP1S2P56377 157 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 NTRK2Q16620 822 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 C3orf38Q5JPI3 329 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 MORN1Q5T089 497 aa16.85■□□□□ 0.29
PREB-208ENST00000468045 FAM27D1Q5T7N8 215 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms