RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	GPR183	P32249	361 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	XG	P55808	180 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58	1e-7	■■□□□ 11.7
RBBP4-208	ENST00000463378	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SYCP1	Q15431	976 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	LMO3	Q8TAP4	145 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	MCHR2	Q969V1	340 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	CD109	Q6YHK3	1445 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	DOCK7	Q96N67	2140 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SSH2	Q76I76	1423 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	MSGN1	A6NI15	193 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	MEI4	A8MW99	385 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378		E9PMD0	336 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SGK494	L7N484	410 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	INSIG1	O15503	277 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	MTX2	O75431	263 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	OR4F21	O95013	312 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SNX4	O95219	450 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ANGPTL1	O95841	491 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	FCER2	P06734	321 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF853	P0CG23	659 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	PLA2G2A	P14555	144 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	RPA2	P15927	270 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	PTGFR	P43088	359 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SPIB	Q01892	262 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	CHIT1	Q13231	466 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	GPM6B	Q13491	265 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	RIPK1	Q13546	671 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	GCKR	Q14397	625 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	P2RY14	Q15391	338 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	PDK4	Q16654	411 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	PARP6	Q2NL67	630 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	MAJIN	Q3KP22	176 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	CENPP	Q6IPU0	288 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	NIPAL3	Q6P499	406 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	CES3	Q6UWW8	571 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	VASH2	Q86V25	355 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM131B	Q86XD5	332 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	WDR49	Q8IV35	697 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	NLN	Q9BYT8	704 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ADGRB3	O60242	1522 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1W2PP64	1363 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	IFT172	Q9UG01	1749 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SPAG6	O75602	509 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ANP32D	O95626	131 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC1A6	P48664	564 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	NDST1	P52848	882 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	PAX9	P55771	341 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	PHEX	P78562	749 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	RBBP4	Q09028	425 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	NFATC2	Q13469	925 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIP10	Q15642	601 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBBP4-208	ENST00000463378	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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