RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV3-11P04433 115 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 COX6A1P12074 109 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 S1PR1P21453 382 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PTGER1P34995 402 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PRIM2P49643 509 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC26A5P58743 744 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PSME3P61289 254 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 GAB1Q13480 694 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TP53BP2Q13625 1128 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 IL10RAQ13651 578 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PCOLCEQ15113 449 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ZSCAN26Q16670 478 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 FHL5Q5TD97 284 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SAXO2Q658L1 398 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MRGPREQ86SM8 312 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 VASH2Q86V25 355 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PGAM4Q8N0Y7 254 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 M1APQ8TC57 530 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF721Q8TF20 911 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 THAP4Q8WY91 577 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 GATA6Q92908 595 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 NCLNQ969V3 563 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 VMP1Q96GC9 406 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC35G5Q96KT7 338 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MS4A4EQ96PG1 132 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 OR10A5Q9H207 317 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 NANOGQ9H9S0 305 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 P4HTMQ9NXG6 502 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC14CA4D256 554 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DUXAA6NLW8 204 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 FXYD1O00168 92 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFAND5O76080 213 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMG1O95456 288 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 AGR2O95994 175 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MATN1P21941 496 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC6A2P23975 617 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SSTR4P31391 388 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SOX18P35713 384 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CLCN2P51788 898 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR143P51810 404 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 RRADP55042 308 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC37A1P57057 533 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DCAF7P61962 342 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A3Q00325 362 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 FADDQ13158 208 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MYBPC3Q14896 1274 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 BTBD16Q32M84 506 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 GTDC1Q4AE62 458 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 BROXQ5VW32 411 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 HSDL2Q6YN16 418 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 RINLQ6ZS11 566 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC29A4Q7RTT9 530 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP24Q8N264 748 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CDRT4Q8N9R6 151 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 OR8K3Q8NH51 312 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DOK4Q8TEW6 326 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ECSITQ9BQ95 431 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms