RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 C17orf47Q8NEP4 570 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CTHRC1Q96CG8 243 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 MYNNQ9NPC7 610 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CNIH4Q9P003 139 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 DTX4Q9Y2E6 619 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TP53I11O14683 189 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 GLSO94925 669 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CBX7O95931 251 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 SOX18P35713 384 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 KCNJ2P63252 427 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 DUSP8Q13202 625 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 FAM71E1Q6IPT2 247 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 FGD2Q7Z6J4 655 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 TICAM1Q8IUC6 712 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 HOMEZQ8IX15 550 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 SIMC1Q8NDZ2 872 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 OR52R1Q8NGF1 315 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 OR9A2Q8NGT5 310 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF675Q8TD23 568 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC120Q96HB5 630 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 BBS4Q96RK4 519 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ITPAQ9BY32 194 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CENPHQ9H3R5 247 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 LRTM1Q9HBL6 345 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf109Q9NX04 203 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PRODH2Q9UF12 536 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 TRAF6Q9Y4K3 522 aa22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PRRG2O14669 202 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 BPGMP07738 259 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 FGF4P08620 206 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 LINC00032P0C843 101 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 NEFHP12036 1026 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PRPH2P23942 346 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PTGS2P35354 604 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 FBXW4P57775 412 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 FOXO1Q12778 655 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 RPS6KA2Q15349 733 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 NNATQ16517 81 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF628Q5EBL2 1059 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PAOXQ6QHF9 649 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 RNF165Q6ZSG1 346 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PRR22Q8IZ63 422 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CLYBLQ8N0X4 340 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 KAT2AQ92830 837 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 TUBB1Q9H4B7 451 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa22.06■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF407Q9C0G0 2248 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CYSRT1A8MQ03 144 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM233B4DJY2 109 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 NPIPB8E9PQR5 432 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 LRATO95237 230 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 MPIP34949 423 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 SERPINB5P36952 375 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA0040Q15053 153 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 Q6ZSR9 355 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 IKBIPQ70UQ0 350 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 DDIASQ8IXT1 998 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 FAM9CQ8IZT9 166 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 FAM109AQ8N4B1 249 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM251Q8N6I4 163 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 OR2T11Q8NH01 316 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 AGR3Q8TD06 166 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 TWIST2Q8WVJ9 160 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 DIO2Q92813 273 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ZBTB9Q96C00 473 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ERP27Q96DN0 273 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PLSCR2Q9NRY7 297 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PCNX1Q96RV3 2341 aa22.05■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 TPOP07202 933 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ABCD3P28288 659 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ETV4P43268 484 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 MAGEA5P43359 124 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 EMDP50402 254 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CEBPEQ15744 281 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 HYAL4Q2M3T9 481 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 SH2D4BQ5SQS7 431 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 DOLPP1Q86YN1 238 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms