RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 MID1IP1Q9NPA3 183 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 QPCTLQ9NXS2 382 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 UTS2RQ9UKP6 389 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 PCDH7O60245 1069 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 IL3P08700 152 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 KRT15P19012 456 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 CRHR1P34998 444 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 SLCO1A2P46721 670 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 NAA20P61599 178 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ACSM2AQ08AH3 577 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 PMPCAQ10713 525 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 DUSP8Q13202 625 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC153Q494R4 210 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 SPIN4Q56A73 249 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM198Q66K66 360 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ACSM2BQ68CK6 577 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM180BQ6P0A1 224 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 GALNT18Q6P9A2 607 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 SIMC1Q8NDZ2 872 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 SARAFQ96BY9 339 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ANGPTL4Q9BY76 406 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ACKR4Q9NPB9 350 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 SIRT5Q9NXA8 310 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 BCAP29Q9UHQ4 241 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ACAD8Q9UKU7 415 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 RNF6Q9Y252 685 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 PLIN3O60664 434 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 CBX7O95931 251 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 NAGAP17050 411 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ACVR2AP27037 513 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCD3P28288 659 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 FOXA1P55317 472 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 NUP107P57740 925 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF585AQ6P3V2 769 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 SCIMPQ6UWF3 145 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ACAD11Q709F0 780 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 LILRB4Q8NHJ6 448 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 NTNG2Q96CW9 530 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 EXO5Q9H790 373 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 NINQ8N4C6 2090 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 FIGNL2A6NMB9 653 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 SNX4O95219 450 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 CHRNB4P30926 498 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.127e-8■■■■■ 35
PPP1CB-208ENST00000455580 CASP3P42574 277 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 NAGLUP54802 743 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 DNAJB13P59910 316 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 BTKQ06187 659 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 LTB4RQ15722 352 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 BICRALQ6AI39 1079 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 PRR22Q8IZ63 422 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ACBD4Q8NC06 268 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 HSPBAP1Q96EW2 488 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 SPOCK3Q9BQ16 436 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ITPAQ9BY32 194 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 ENKD1Q9H0I2 346 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 SPRR3Q9UBC9 169 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 PLLPQ9Y342 182 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP1CB-208ENST00000455580 SMIM23A6NLE4 172 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 H3BQF6 201 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 EMDP50402 254 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 RPP38P78345 283 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 WLSQ5T9L3 541 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 RTL6Q6ICC9 239 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 FRMD7Q6ZUT3 714 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 GDF7Q7Z4P5 450 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 OR52R1Q8NGF1 315 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF675Q8TD23 568 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF597Q96LX8 424 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 RILPQ96NA2 401 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 TTYH2Q9BSA4 534 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIM8Q9BZR9 551 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 OXSMQ9NWU1 459 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 B4GALT7Q9UBV7 327 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 PRODH2Q9UF12 536 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM215AQ9Y5M1 114 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-208ENST00000455580 PKDREJQ9NTG1 2253 aa22.01■■□□□ 1.11
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