RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 GAS1P54826 345 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CASP9P55211 416 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RAB42Q8N4Z0 105 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SCLYQ96I15 445 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 LRR1Q96L50 414 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TOX2Q96NM4 488 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 BTBD1Q9H0C5 482 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SPNS1Q9H2V7 528 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TDP1Q9NUW8 608 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TVP23BQ9NYZ1 205 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 A8MU76 341 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 NDUFS4O43181 175 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SSX4O60224 188 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SEMA7AO75326 666 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SOX14O95416 240 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 HLA-DPB1P04440 258 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MAP2K3P46734 347 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CAPZA2P47755 286 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ST8SIA6P61647 398 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TP53BP2Q13625 1128 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF77Q15935 545 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CYP27C1Q4G0S4 372 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 HACD4Q5VWC8 232 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PLET1Q6UQ28 207 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 OR56A1Q8NGH5 318 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 OR52N1Q8NH53 320 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TTC9Q92623 222 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 FOXJ1Q92949 421 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 DEFB118Q96PH6 123 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 OR2AG1Q9H205 316 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC88CQ9P219 2028 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GPR89AB7ZAQ6 455 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGEF9O43307 516 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 POP7O75817 140 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 UBXN7O94888 489 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GPR89BP0CG08 455 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 NR2F1P10589 423 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CD53P19397 219 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MMP11P24347 488 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 NTSP30990 170 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ETV5P41161 510 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GPR1P46091 355 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MTNR1AP48039 350 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ETV1P50549 477 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TSPAN31Q12999 210 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 DSG2Q14126 1118 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 DOC2BQ14184 412 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TRIQKQ629K1 86 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 KREMEN2Q8NCW0 462 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 VN1R2Q8NFZ6 395 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM246Q9BRR3 403 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SLC43A1O75387 559 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TNNI3P19429 210 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 STAT5AP42229 794 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GNG2P59768 71 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TNK1Q13470 666 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TRAM2Q15035 370 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SNAPC1Q16533 368 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PYDC2Q56P42 97 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM215Q68D42 235 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF485Q8NCK3 441 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 C19orf18Q8NEA5 215 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZFAND1Q8TCF1 268 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 OSTF1Q92882 214 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RNFT2Q96EX2 444 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MARCH7Q9H992 704 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms