RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 SYT10Q6XYQ8 523 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 SH2D5Q6ZV89 423 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q7L0L9 218 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NFE4Q86UQ8 179 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPEM1Q8N4L4 309 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 STPG4Q8N801 248 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NIPA2Q8N8Q9 360 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAB21L3Q8N8X9 362 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANKFN1Q8N957 763 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR4F5Q8NH21 305 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 GOLGA5Q8TBA6 731 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 RAET1EQ8TD07 263 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC41A3Q96GZ6 507 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR4F4Q96R69 305 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC77Q9BR77 488 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 APOOQ9BUR5 198 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERVK-6Q9BXR3 956 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 DCTPP1Q9H773 170 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 METTL7AQ9H8H3 244 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 MED20Q9H944 212 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 STARD5Q9NSY2 213 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 IKZF3Q9UKT9 509 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMED5Q9Y3A6 229 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A1W2PR80 420 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TTC26A0AVF1 554 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 METTL21EPA6NDL7 271 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TCP10L2B9ZVM9 353 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CUX2O14529 1486 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZSCAN12O43309 604 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANP32DO95626 131 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PEX19P40855 299 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NDST1P52848 882 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ART1P52961 327 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CDKL1Q00532 357 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC17A1Q14916 467 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CDKN3Q16667 212 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 DDI2Q5TDH0 399 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TAF3Q5VWG9 929 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 RNF123Q5XPI4 1314 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIAA1328Q86T90 577 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 LACC1Q8IV20 430 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM178AQ8NBL3 297 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TM9SF4Q92544 642 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 DYRK2Q92630 601 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTPRUQ92729 1446 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NT5C3BQ969T7 300 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NFKBIZQ9BYH8 718 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 RHOJQ9H4E5 214 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ALG9Q9H6U8 611 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 STK36Q9NRP7 1315 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 C2orf42Q9NWW7 574 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPR83Q9NYM4 423 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa3.57□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 MSGN1A6NI15 193 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 IFITM10A6NMD0 228 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMCO5BA8MYB1 307 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 H0Y8G0 127 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 H3BTX0 84 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARPC3O15145 178 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ALOX15BO15296 676 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CTAGE5O15320 804 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 MED7O43513 233 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CIB2O75838 187 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CAVIN2O95810 425 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGKV3-20P01619 116 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGHEP01854 428 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 GSTA1P08263 222 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 GRIA1P42261 906 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPT1P50897 306 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PEX3P56589 373 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms