RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMU1Q2TAY7 513 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL23RQ5VWK5 629 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTL4Q6ZR62 310 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF227Q86WZ6 799 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAGAPQ8N103 731 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C17orf47Q8NEP4 570 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAR1Q8WVX9 515 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TP53INP1Q96A56 240 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTERF3Q96E29 417 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAAR6Q96RI8 345 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUF2Q9BZD4 464 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLCO1B7G3V0H7 640 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NADKO95544 446 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPX3P22352 226 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NRG3P56975 720 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP2R2AP63151 447 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OCRLQ01968 901 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EMX2Q04743 252 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDE7AQ13946 482 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTGR1Q14914 329 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRSS53Q2L4Q9 553 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MDGA2Q7Z553 956 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF441Q8N8Z8 693 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLM1Q8NBJ4 401 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSD4Q8NDX1 1056 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAJB8Q8NHS0 232 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZFP28Q8NHY6 868 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KAT2AQ92830 837 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SGCZQ96LD1 299 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AMDHD1Q96NU7 426 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITPAQ9BY32 194 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASIC5Q9NY37 505 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RELNP78509 3460 aa16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UQCRHLA0A096LP55 91 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASPDHA6ND91 283 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRPC5OSA6NMA1 111 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HDAC3O15379 428 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLOD3O60568 738 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COQ9O75208 318 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KITP10721 976 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PMP22Q01453 160 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DUSP8Q13202 625 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC8CQ8TDW0 803 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NR4A3Q92570 626 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADIPOR1Q96A54 375 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLIPR2Q9H4G4 154 aa16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAPN14A8MX76 684 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO45P0C2W1 286 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 G6PDP11413 515 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EDN3P14138 238 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LBPP18428 481 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRPS1L1P21108 318 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPC1P35052 558 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOX18P35713 384 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MC3RP41968 323 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EMDP50402 254 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCAF7P61962 342 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSPB3Q12988 150 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NNATQ16517 81 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF385BQ569K4 471 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM107Q6UX40 140 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIMC1Q8NDZ2 872 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR7G2Q8NG99 324 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FRMD6Q96NE9 622 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLX1AQ9BQ83 275 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAS2R9Q9NYW1 312 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DTX4Q9Y2E6 619 aa16.03■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A087WV62 115 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLOD2O00469 737 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PEX1O43933 1283 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms