RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 GALNSP34059 522 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CASP2P42575 452 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 NRG3P56975 720 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 RPS13P62277 151 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 VEZF1Q14119 521 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 PDK4Q16654 411 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 SCIMPQ6UWF3 145 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 TCAIMQ8N3R3 496 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF615Q8N8J6 731 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 WDSUB1Q8N9V3 476 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 HGDQ93099 445 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 REG4Q9BYZ8 158 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CXorf56Q9H5V9 222 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 PHF11Q9UIL8 331 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 PSAT1Q9Y617 370 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC14BA6NHZ5 514 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 C16orf97H3BN30 126 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CDH16O75309 829 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CBR3O75828 277 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 TP53P04637 393 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN18P56856 261 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 SIRPAP78324 504 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 SLC30A6Q6NXT4 461 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 P4HA3Q7Z4N8 544 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 LAS2Q8IYD9 372 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA6LQ8N4H0 392 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CMTM7Q96FZ5 175 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 OSBPL11Q9BXB4 747 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 OR10A5Q9H207 317 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ACTR8Q9H981 624 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CXorf21Q9HAI6 301 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ELOVL5Q9NYP7 299 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 HEY2Q9UBP5 337 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 DTX4Q9Y2E6 619 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PR48 441 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 PLPP1O14494 284 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 KLF4O43474 513 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CD5LO43866 347 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 PPM1BO75688 479 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CRHP06850 196 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 THBDP07204 575 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 RHOXF2BP0C7M4 288 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35E2BP0CK96 405 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35E2P0CK97 266 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF708P17019 499 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 KRT15P19012 456 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 KCNJ5P48544 419 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 E2F2Q14209 437 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 TBCCQ15814 346 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 MED27Q6P2C8 311 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM81Q6P7N7 255 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 IFNEQ86WN2 208 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF610Q8N9Z0 462 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 OR7G3Q8NG95 312 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 RGMAQ96B86 450 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP36Q96G28 342 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 NAT9Q9BTE0 207 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 RNF112Q9ULX5 631 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ASB4Q9Y574 426 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ABCA1O95477 2261 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CGAP01215 116 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 RAP1GDS1P52306 607 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 NNATQ16517 81 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 SULT1C3Q6IMI6 304 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 SH2D5Q6ZV89 423 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 NUP54Q7Z3B4 507 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 GPSM1Q86YR5 675 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 SLC39A3Q9BRY0 314 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 TAS2R10Q9NYW0 307 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ROS1P08922 2347 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 TMPRSS11DO60235 418 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 EEDO75530 441 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 GPX3P22352 226 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 CHRFAM7AQ494W8 412 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 BEX5Q5H9J7 111 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 OR2A2Q6IF42 318 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 GALNT12Q8IXK2 581 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF611Q8N823 705 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 FIG4Q92562 907 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2E3Q969T4 207 aa17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms