RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 TSPAN33Q86UF1 283 aa11.67□□□□□ -0.54
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SZRD1-201ENST00000401088 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
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SZRD1-201ENST00000401088 S100A11P31949 105 aa11.66□□□□□ -0.54
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SZRD1-201ENST00000401088 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.66□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.545e-13■■■■□ 26.2
SZRD1-201ENST00000401088 LPPQ93052 612 aa11.66□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 DPH7Q9BTV6 452 aa11.66□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 PRR14Q9BWN1 585 aa11.66□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SZRD1-201ENST00000401088 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa11.66□□□□□ -0.54
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