RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372108.9

GTF3C5-204, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C5, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-204ENST00000372108 PIGKQ92643 395 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 SLC35A4Q96G79 324 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 FITM1A5D6W6 292 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 H3BNH8 94 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 ADAMDEC1O15204 470 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 DUX1O43812 170 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 SERPINB7O75635 380 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 H6PDO95479 791 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 CSF2RBP32927 897 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 PIGAP37287 484 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 KCNC4Q03721 635 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 KCNAB2Q13303 367 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 TCTE1Q5JU00 501 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 BBS10Q8TAM1 723 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 MUS81Q96NY9 551 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 EXD2Q9NVH0 621 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 PI4KAP42356 2102 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 A0A1B0GTQ1 180 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 TNFRSF11BO00300 401 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 DNAJB5O75953 348 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 IFNW1P05000 195 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 IGFBP5P24593 272 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 SEPHS1P49903 392 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 RPS6KA3P51812 740 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 GPLD1P80108 840 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 MGAT2Q10469 447 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 EPS8Q12929 822 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 GNA13Q14344 377 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 INAVAQ3KP66 663 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 GPAT3Q53EU6 434 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 KRT73Q86Y46 540 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 SLC16A11Q8NCK7 471 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 PROX1Q92786 737 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 PIP5K1AQ99755 562 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 GIN1Q9NXP7 522 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 C3orf18Q9UK00 162 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-204ENST00000372108 A0A0G2JPF8 293 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 H3BMH7 237 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 ETS2P15036 469 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 NT5EP21589 574 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 FUT4P22083 530 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 SKP1P63208 163 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 HSD11B2P80365 405 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 SPIBQ01892 262 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 SYT16Q17RD7 645 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 HLA-BQ31612 363 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 CDC73Q6P1J9 531 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 FAHD1Q6P587 224 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 ZNF605Q86T29 641 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 COMTD1Q86VU5 262 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 CARFQ8N187 725 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 SAP25Q8TEE9 199 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 PEX11GQ96HA9 241 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 LIPT1Q9Y234 373 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 A0A087WV62 115 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 PLOD3O60568 738 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 RHCEP18577 417 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 RAD23AP54725 363 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 CDH12P55289 794 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C5-204ENST00000372108 RFX4Q33E94 735 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms