RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 NELL2Q99435 816 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ABCG4Q9H172 646 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 Q9N2J8 555 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 BRD7Q9NPI1 651 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SEMA4GQ9NTN9 838 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TDP1Q9NUW8 608 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TSPAN3O60637 253 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 EEF1DP3Q658K8 133 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF10AO00220 468 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 OR52E8Q6IFG1 317 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 F5H5P2 479 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 A8MT66 165 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 I6L893 689 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
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