RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENTPD4Q9Y227 616 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 A1L4Q6 167 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM166BA8MTA8 275 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGS14O43566 566 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC22BO75396 215 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLSO94925 669 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 P04436 131 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PER3P56645 1201 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf80Q0P641 193 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXO1Q12778 655 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 NTRK2Q16620 822 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT3A2Q3SY77 523 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM47EQ6ZV65 393 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPPL2CQ8IUH8 684 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXW8Q8N3Y1 598 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52R1Q8NGF1 315 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52N2Q8NGI0 321 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKNOX2Q96KN3 472 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITPAQ9BY32 194 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLSCR2Q9NRY7 297 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf109Q9NX04 203 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCAP29Q9UHQ4 241 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 TINAGQ9UJW2 476 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTIFO43310 598 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZG16O60844 167 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHEK2O96017 543 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00032P0C843 101 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 TACR1P25103 407 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINB5P36952 375 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGAP37287 484 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINB4P48594 390 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPIAP62937 165 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLGLB1Q02325 96 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 NNATQ16517 81 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF20Q5VT98 475 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CES4AQ5XG92 561 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A10Q63ZE4 541 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 IKBIPQ70UQ0 350 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 TICAM1Q8IUC6 712 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLYBLQ8N0X4 340 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGR3Q8TD06 166 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPHQ9H3R5 247 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRA2Q9H9E1 313 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROK2Q9HC23 129 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 MIEF1Q9NQG6 463 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFL2Q9Y281 166 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC13O75165 2243 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCNX1Q96RV3 2341 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa18■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYSRT1A8MQ03 144 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO1GB0I1T2 1018 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACOT7O00154 380 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIP5K1BO14986 540 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSM1O15116 133 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRATO95237 230 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDN1O95832 211 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABOP16442 354 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMDP50402 254 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXW4P57775 412 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL38P63173 70 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS6KA2Q15349 733 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 HYAL4Q2M3T9 481 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRIG3Q6UXM1 1119 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDIASQ8IXT1 998 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR22Q8IZ63 422 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM9CQ8IZT9 166 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5M3Q8NGP4 307 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 KAT2AQ92830 837 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERP27Q96DN0 273 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 EGLN2Q96KS0 407 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCT7Q99832 543 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL1RL2Q9HB29 575 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R7Q9NYW3 318 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNIH4Q9P003 139 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCKAP5O14513 1909 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 NINQ8N4C6 2090 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GTH9 108 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL21O00585 134 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS4L1P0CG22 281 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDC1P18827 310 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCD3P28288 659 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASP6P55212 293 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRG3P56975 720 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 XKR7Q5GH72 579 aa17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms