RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	DOK1	Q99704	481 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1W2PP55	124 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	HCN1	O60741	890 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	TOX	O94900	526 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ABLIM3	O94929	683 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	MPI	P34949	423 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC6A12	P48065	614 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC6A11	P48066	632 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	GNA13	Q14344	377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM63	Q969Q1	353 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	IFNA16	P05015	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	FURIN	P09958	794 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	CBL	P22681	906 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	DEFB134	Q4QY38	66 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	OOSP2	Q86WS3	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	COQ8B	Q96D53	544 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	PARP14	Q460N5	1801 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525		H0YIV9	168 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRTM2	O43300	516 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB36	O95755	333 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	NPIPA8	P0DM63	369 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	PCMT1	P22061	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ACTR1B	P42025	376 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	KHK	P50053	298 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ACTR1A	P61163	376 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	MLIP	Q5VWP3	458 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	MED28	Q9H204	178 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ACADM	P11310	421 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	MTNR1A	P48039	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	WNT3	P56703	355 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB14	P61106	215 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	YIPF6	Q96EC8	236 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ACER3	Q9NUN7	267 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	LCT	P09848	1927 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	GFY	I3L273	518 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525		M0R082	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	GPX5	O75715	221 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	PTTG1	O95997	202 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ASGR2	P07307	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	GNS	P15586	552 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	GRK5	P34947	590 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	CASP3	P42574	277 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	DCDC1	P59894	354 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	SELENBP1	Q13228	472 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	NDUFA5	Q16718	116 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	NRM	Q8IXM6	262 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	ITPKC	Q96DU7	683 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	BRF2	Q9HAW0	419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-223	ENST00000639525	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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