RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635970.1

CLN8-209, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN8, Length 1,958 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-209ENST00000635970 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CORO2BQ9UQ03 480 aa14.67□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.67□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 M0R082 166 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CLIC1O00299 241 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 DKK1O94907 266 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 KRT8P05787 483 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 GGT2P36268 569 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CASP3P42574 277 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 RPE65Q16518 533 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 C10orf111Q8N326 155 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 SETD6Q8TBK2 473 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 OR5K4A6NMS3 321 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 GSTM1P09488 218 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PPIBP23284 216 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 VLDLRP98155 873 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ZNF544Q6NX49 715 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 METTL4Q8N3J2 472 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 TMEM159Q96B96 161 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PYCR2Q96C36 320 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 SNX18Q96RF0 628 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 NEK6Q9HC98 313 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 RASSF1Q9NS23 344 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 KRT75O95678 551 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PDYNP01213 254 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 VIPP01282 170 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 GP1BAP07359 652 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 OR1D5P58170 312 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 C21orf58P58505 322 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 SGO1Q5FBB7 561 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 AGAP6Q5VW22 663 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 DESI1Q6ICB0 168 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PDZD3Q86UT5 571 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CCDC103Q8IW40 242 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ZNF675Q8TD23 568 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 FCRL1Q96LA6 429 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 AGAP4Q96P64 663 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CFL2Q9Y281 166 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 A0A1W2PQM1 296 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 DSCR3O14972 297 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ADAMDEC1O15204 470 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ANXA8P13928 327 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SDC1P18827 310 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 GADD45AP24522 165 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 CDKN2CP42773 168 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 GDF5P43026 501 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SEPHS1P49903 392 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 UGT2B15P54855 530 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 IFITM2Q01629 132 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 RPA4Q13156 261 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 GPR18Q14330 331 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SYT16Q17RD7 645 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 GPR155Q7Z3F1 870 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 PANX1Q96RD7 426 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SLC38A3Q99624 504 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 NRTNQ99748 197 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms