RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627441.2

SPTAN1-212, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-212ENST00000627441 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 B4DSR2 109 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 CYR61O00622 381 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 TIMM23O14925 209 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 FRS3O43559 492 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 KNG1P01042 644 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 CLPSP04118 112 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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SPTAN1-212ENST00000627441 RAB38P57729 211 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 GPS1Q13098 491 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 PWP1Q13610 501 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 RPS6KA1Q15418 735 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 MST1LQ2TV78 715 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 CTSL3PQ5NE16 218 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 CCDC25Q86WR0 208 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 RFX6Q8HWS3 928 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 NT5CQ8TCD5 201 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 STYXQ8WUJ0 223 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 HAUS1Q96CS2 278 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 MTBPQ96DY7 904 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 NODALQ96S42 347 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 P2RY12Q9H244 342 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.13□□□□□ -1.27
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SPTAN1-212ENST00000627441 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 TP53I11O14683 189 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 WNT9BO14905 357 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 NIPSNAP2O75323 286 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 PNPP00491 289 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 FERP16591 822 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 PSMA3P25788 255 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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SPTAN1-212ENST00000627441 BTN3A2P78410 334 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 FGFBP1Q14512 234 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 NFKBIBQ15653 356 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 Q6ZSR9 355 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 BEND4Q6ZU67 534 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 CARM1Q86X55 608 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.12□□□□□ -1.27
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SPTAN1-212ENST00000627441 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.12□□□□□ -1.27
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SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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SPTAN1-212ENST00000627441 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 NGBQ9NPG2 151 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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SPTAN1-212ENST00000627441 MID2Q9UJV3 735 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 MROH6A6NGR9 719 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-212ENST00000627441 GOLGA8RI6L899 631 aa7.11□□□□□ -1.27
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