RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612980.4

RDM1-215, Transcript of RAD52 motif containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 501 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1-215ENST00000612980 UNC5DQ6UXZ4 953 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 LINC00299Q6ZSB3 139 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ANKRD46Q86W74 232 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 FAM129CQ86XR2 697 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ZNF547Q8IVP9 402 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 CFAP206Q8IYR0 622 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 OFCC1Q8IZS5 231 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 HS3ST5Q8IZT8 346 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 CLEC4FQ8N1N0 589 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 METTL4Q8N3J2 472 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 RNF175Q8N4F7 328 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 VPS37AQ8NEZ2 397 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 OR9A1PQ8NGU1 263 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 OR2T29Q8NH02 315 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 OR2L2Q8NH16 312 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 WDR48Q8TAF3 677 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ZNF480Q8WV37 535 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 TANKQ92844 425 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 NEIL2Q969S2 332 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ISOC1Q96CN7 298 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 REPS1Q96D71 796 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 MTERF3Q96E29 417 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 C14orf79Q96F83 325 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 COX14Q96I36 57 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 FOPNLQ96NB1 174 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 PANX1Q96RD7 426 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 CSF3RQ99062 836 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 EFCAB11Q9BUY7 163 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 OR52A5Q9H2C5 316 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 RHBGQ9H310 441 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 REEP4Q9H6H4 257 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 EPS8L2Q9H6S3 715 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 TPT1P8Q9HAU6 139 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 VNN3Q9NY84 501 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 FZD4Q9ULV1 537 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ICKQ9UPZ9 632 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 CORO2BQ9UQ03 480 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 CDC14CA4D256 554 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 KRT87PA6NCN2 255 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 A6NCN8 305 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 POM121BA6NF01 834 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 INAFM1C9JVW0 142 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 H3BMQ9 156 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 B4GAT1O43505 415 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 LRATO95237 230 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 CSF2P04141 144 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 HEXAP06865 529 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 HTR1AP08908 422 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ELFN1P0C7U0 828 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 COX7A2P14406 83 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 FOSL1P15407 271 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 TEAD1P28347 426 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 PCGF2P35227 344 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 HSD17B2P37059 387 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 PIGAP37287 484 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 RPL3P39023 403 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 YAP1P46937 504 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 PREPP48147 710 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 MEOX1P50221 254 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ARHGDIAP52565 204 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 RAB15P59190 212 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ST8SIA6P61647 398 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 HPCAP84074 193 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 VLDLRP98155 873 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 Q0VFX4 171 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 ARHGAP19Q14CB8 494 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 CYP2A13Q16696 494 aa4.49□□□□□ -1.69
RDM1-215ENST00000612980 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms