RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	MGA	Q8IWI9	3026 aa		11.96	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PCDH17	O14917	1159 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PLOD3	O60568	738 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	RAD1	O60671	282 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NTRK1	P04629	796 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	HTR1E	P28566	365 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SLC7A2	P52569	658 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	OCA2	Q04671	838 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	STX4	Q12846	297 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	MAP4K2	Q12851	820 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	FADD	Q13158	208 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SLC13A2	Q13183	592 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CEACAM7	Q14002	265 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SNCB	Q16143	134 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SYT16	Q17RD7	645 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	COX15	Q7KZN9	410 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SERPINA11	Q86U17	422 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	DTX1	Q86Y01	620 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NKD1	Q969G9	470 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ELP4	Q96EB1	424 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	WDR54	Q9H977	334 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ADA2	Q9NZK5	511 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NME4	O00746	187 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	EMC8	O43402	210 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	KALRN	O60229	2985 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	B4GALT2	O60909	372 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	LDB3	O75112	727 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	STK17B	O94768	372 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	GSN	P06396	782 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	BMP2	P12643	396 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	STT3A	P46977	705 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	GZMM	P51124	257 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	MVD	P53602	400 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PRR5	P85299	388 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	PLIN5	Q00G26	463 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	RGN	Q15493	299 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	RABL3	Q5HYI8	236 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	C1orf189	Q5VU69	101 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SAXO2	Q658L1	398 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	OR2L13	Q8N349	312 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	FAM13C	Q8NE31	585 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF583	Q96ND8	569 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ALG2	Q9H553	416 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF639	Q9UID6	485 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CELF4-222	ENST00000601392	ATP6V1G2	O95670	118 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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