RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600026.5

LTBP4-227, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-227	ENST00000600026	DNAJB5	O75953	348 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	C6orf47	O95873	294 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	ITGB2	P05107	769 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	GPC1	P35052	558 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	STT3A	P46977	705 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	MNAT1	P51948	309 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	TLR1	Q15399	786 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	ANKRD46	Q86W74	232 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	CCDC115	Q96NT0	180 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	20.48	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	MRAS	O14807	208 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	DYRK3	O43781	588 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	UBOX5	O94941	541 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	ATP1B1	P05026	303 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	CELA2A	P08217	269 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	TNNI3	P19429	210 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	NT5E	P21589	574 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	GALNS	P34059	522 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	TRPC1	P48995	793 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC26A5	P58743	744 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026		Q0VFX4	171 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	HSPB3	Q12988	150 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	REP15	Q6BDI9	236 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	PANX1	Q96RD7	426 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	ASPDH	A6ND91	283 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	FBP2	O00757	339 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	RFXANK	O14593	260 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	SLITRK5	O94991	958 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	KCNH1	O95259	989 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	ANP32D	O95626	131 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	CALB2	P22676	271 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	RHD	Q02161	417 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	DUSP2	Q05923	314 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	DPP10	Q8N608	796 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	TTC9	Q92623	222 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	GTF2H4	Q92759	462 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	RCN3	Q96D15	328 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	GID8	Q9NWU2	228 aa		20.46	■□□□□ 0.87
LTBP4-227	ENST00000600026	AIM2	O14862	343 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	CBX6	O95503	412 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	NFYC	Q13952	458 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	EXT1	Q16394	746 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	BTBD16	Q32M84	506 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	LINC00303	Q3SY05	128 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	GALNT16	Q8N428	558 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	NPAS2	Q99743	824 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	VPS4A	Q9UN37	437 aa		20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026		A0A096LPI6	279 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	C17orf105	B2RV13	164 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	SERPINA7	P05543	415 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	ITGA3	P26006	1051 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	SOAT1	P35610	550 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	CPA2	P48052	419 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	CCL11	P51671	97 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	POLE2	P56282	527 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	HBA1	P69905	142 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	MXRA7	P84157	204 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	ART3	Q13508	389 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		20.44	■□□□□ 0.86
LTBP4-227	ENST00000600026	RETREG3	Q86VR2	466 aa		20.44	■□□□□ 0.86

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