RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 GTF2H2Q13888 395 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-208ENST00000590422 RPS6KA2Q15349 733 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-208ENST00000590422 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
CTIF-208ENST00000590422 DCST1Q5T197 706 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-208ENST00000590422 LIPJQ5W064 366 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-208ENST00000590422 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-208ENST00000590422 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-208ENST00000590422 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
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CTIF-208ENST00000590422 LIX1Q8N485 282 aa11.09□□□□□ -0.63
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CTIF-208ENST00000590422 POM121Q96HA1 1249 aa11.09□□□□□ -0.63
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CTIF-208ENST00000590422 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
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CTIF-208ENST00000590422 QPCTLQ9NXS2 382 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-208ENST00000590422 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.09□□□□□ -0.63
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CTIF-208ENST00000590422 A0A087X1B8 175 aa11.08□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 FAM221AA4D161 298 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 HSPB2A8KAH6 182 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 OR7A17O14581 309 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 UGDHO60701 494 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 SLC35E2P0CK97 266 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 ARFIP1P53367 373 aa11.08□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 BIKQ13323 160 aa11.08□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 NNATQ16517 81 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 DESI1Q6ICB0 168 aa11.08□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 C7orf57Q8NEG2 295 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 OR52B6Q8NGF0 335 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 SPPL2AQ8TCT8 520 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 NINJ1Q92982 152 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ISL2Q96A47 359 aa11.08□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 GNRHR2Q96P88 292 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 TIMP4Q99727 224 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 FOXC2Q99958 501 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 RASSF1Q9NS23 344 aa11.08□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 CBLCQ9ULV8 474 aa11.08□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 C15orf41Q9Y2V0 281 aa11.08□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 SYT5O00445 386 aa11.07□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 KLHL2O95198 593 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ACSL3O95573 720 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 EPPINO95925 133 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 CD99P14209 185 aa11.07□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 SOX18P35713 384 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 MAGEA12P43365 314 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ASCL1P50553 236 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 FUT7Q11130 342 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ACAP2Q15057 778 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 FAM83EQ2M2I3 478 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 FLYWCH1Q4VC44 716 aa11.07□□□□□ -0.64
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