RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544910.5

VPS50-220, Transcript of VPS50, EARP/GARPII complex subunit, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS50, Length 5,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50-220ENST00000544910 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 A0A1B0GTW7 788 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 SNX4O95219 450 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 OR5F1O95221 314 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CXCL10P02778 98 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 EPCAMP16422 314 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 ACSL1P33121 698 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 VEGFBP49765 207 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CSRP3P50461 194 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CDH11P55287 796 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 KDM4DQ6B0I6 523 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CEP68Q76N32 757 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 OAFQ86UD1 273 aa5.5□□□□□ -1.53
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VPS50-220ENST00000544910 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 GRHL3Q8TE85 626 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 ZFP90Q8TF47 636 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 TMEM203Q969S6 136 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 RFT1Q96AA3 541 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 NELL2Q99435 816 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 KXD1Q9BQD3 176 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 ASPNQ9BXN1 380 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 C14orf105Q9NVL8 296 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 COMMD3Q9UBI1 195 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 PTPRFP10586 1907 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 SOBPA7XYQ1 873 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 GFYI3L273 518 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 AGRPO00253 132 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 UPK1BO75841 260 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 OR6A2O95222 327 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 SERPINA3P01011 423 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 TNFP01375 233 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 HLA-DQA2P01906 255 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CNR2P34972 360 aa5.5□□□□□ -1.53
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VPS50-220ENST00000544910 VIPR2P41587 438 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 PPP5CP53041 499 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 MLLT10P55197 1068 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 ASPGQ86U10 573 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.5□□□□□ -1.53
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VPS50-220ENST00000544910 ZNF354BQ96LW1 612 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 SAMD11Q96NU1 681 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 MGLLQ99685 303 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 DZANK1Q9NVP4 752 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 GLS2Q9UI32 602 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CDH7Q9ULB5 785 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 HSPB11Q9Y547 144 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 A0A1W2PP55 124 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 WASH3PC4AMC7 463 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 J3KTA2 159 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 DLGAP1O14490 977 aa5.5□□□□□ -1.53
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VPS50-220ENST00000544910 ITGA10O75578 1167 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 VNN2O95498 520 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 PTTG1O95997 202 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 LHCGRP22888 699 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CD40LGP29965 261 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 ACTR1BP42025 376 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 BMXP51813 675 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 ACTR1AP61163 376 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 VLDLRP98155 873 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CST6Q15828 149 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 CCDC107Q8WV48 283 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 S100A13Q99584 98 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 TBX5Q99593 518 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 SLC6A16Q9GZN6 736 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS50-220ENST00000544910 TMEM184CQ9NVA4 438 aa5.5□□□□□ -1.53
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