RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 LRR1Q96L50 414 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 SLC29A1Q99808 456 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 NTMT1Q9BV86 223 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 EURLQ9NYK6 297 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 SCML1Q9UN30 329 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 UTRNP46939 3433 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 ARID1AO14497 2285 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 RNF13O43567 381 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 HPRP00739 348 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 F8A1P23610 371 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PYCR1P32322 319 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PTGER1P34995 402 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 P2RY2P41231 377 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 SGSHP51688 502 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 ZNF33BQ06732 778 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 SNTA1Q13424 505 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 RAB39AQ14964 217 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 C1orf189Q5VU69 101 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 Q6ZSR6 202 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 ZNF627Q7L945 461 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 SLC5A8Q8N695 610 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 ZNF675Q8TD23 568 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 TMEM234Q8WY98 164 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 ADORA3P0DMS8 318 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 BMP2P12643 396 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 GPR4P46093 362 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 RABIFP47224 123 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 CSNK1DP48730 415 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 HLCSP50747 726 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 NSDHLQ15738 373 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 TMEM225Q6GV28 225 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 RNF175Q8N4F7 328 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 OR8K3Q8NH51 312 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 ISOC1Q96CN7 298 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 TTC3P53804 2025 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 MROH6A6NGR9 719 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 NR2C1P13056 603 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 DCKP27707 260 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PMS2P3Q13401 168 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 RGNQ15493 299 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 SPHARQ15513 63 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 CMKLR1Q99788 373 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 ZNF217O75362 1048 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PRLP01236 227 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 RETP07949 1114 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 CERS1P27544 350 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 OXTRP30559 389 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 MAGEA3P43357 314 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 HK3P52790 923 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PITPNAQ00169 270 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PNCKQ6P2M8 343 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 FRS2Q8WU20 508 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 SLC22A4Q9H015 551 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 TIGARQ9NQ88 270 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 IL20RAQ9UHF4 553 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 HCN2Q9UL51 889 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 HYKKA2RU49 373 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 HTR1AP08908 422 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-201ENST00000537686 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms