RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525152.1

PPP6R3-208, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 2

Gene PPP6R3, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-208	ENST00000525152	BRF2	Q9HAW0	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	XPR1	Q9UBH6	696 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152		Q9UFV3	132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	PSME2	Q9UL46	239 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	CFL2	Q9Y281	166 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	C1orf226	A1L170	272 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ACSL3	O95573	720 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	OTC	P00480	354 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	CPM	P14384	443 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	NAGA	P17050	411 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	PEX19	P40855	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	TRAF3	Q13114	568 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21	6e-7	■■■■■ 37.7
PPP6R3-208	ENST00000525152	HSPB2	Q16082	182 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	PACS2	Q86VP3	889 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZNF597	Q96LX8	424 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	FMO2	Q99518	471 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	SNX6	Q9UNH7	406 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	CT62	P0C5K7	136 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	S1PR1	P21453	382 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	NT5E	P21589	574 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	GDF1	P27539	372 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ADH7	P40394	386 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	MAPK12	P53778	367 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	FBXW4	P57775	412 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	MAP4K2	Q12851	820 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	DUSP8	Q13202	625 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	LGSN	Q5TDP6	509 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	IFT81	Q8WYA0	676 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	F8	P00451	2351 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	SYT5	O00445	386 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	EPPIN	O95925	133 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ATP1B1	P05026	303 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	HPN	P05981	417 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	KRT15	P19012	456 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	CASP3	P42574	277 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	MYBPH	Q13203	477 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ARSK	Q6UWY0	536 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMEM64	Q6YI46	380 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	MNS1	Q8NEH6	495 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	LRRC46	Q96FV0	321 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	RILP	Q96NA2	401 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	TIMP4	Q99727	224 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	UBQLN3	Q9H347	655 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152	NIN	Q8N4C6	2090 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PPP6R3-208	ENST00000525152		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PPP6R3-208	ENST00000525152		A0A1W2PS29	197 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PPP6R3-208	ENST00000525152	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PPP6R3-208	ENST00000525152	TRAPPC6A	O75865	159 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PPP6R3-208	ENST00000525152	PDYN	P01213	254 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PPP6R3-208	ENST00000525152	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PPP6R3-208	ENST00000525152	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PPP6R3-208	ENST00000525152	ABCD3	P28288	659 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PPP6R3-208	ENST00000525152	TIMP3	P35625	211 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PPP6R3-208	ENST00000525152	HSD17B3	P37058	310 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PPP6R3-208	ENST00000525152	MASP1	P48740	699 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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