RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF2BQ8N4N8 673 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 CTHRC1Q96CG8 243 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 EGLN2Q96KS0 407 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 DPY30Q9C005 99 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 HPF1Q9NWY4 346 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MAT2BQ9NZL9 334 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 LRFN1Q9P244 771 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 BCAP29Q9UHQ4 241 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF639Q9UID6 485 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDHGB4Q9UN71 923 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 USH1CQ9Y6N9 552 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 CHD6Q8TD26 2715 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MED13Q9UHV7 2174 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 WASHC1A8K0Z3 465 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 AKAP10O43572 662 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 PDGFAP04085 211 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 G6PDP11413 515 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 NAGAP17050 411 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 TACR1P25103 407 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 GPC1P35052 558 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBA3CQ13748 450 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 VPS26BQ4G0F5 336 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 PIGGQ5H8A4 983 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 NXNQ6DKJ4 435 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBA3EQ6PEY2 450 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 CAMKMTQ7Z624 323 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF605Q86T29 641 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLM1Q8NBJ4 401 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 UCN3Q969E3 161 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MOAP1Q96BY2 351 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 HSPBAP1Q96EW2 488 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP1R36Q96LQ0 422 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC28BQ9BUN5 200 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf50Q9BV19 199 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 WWTR1Q9GZV5 400 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 NEUROD4Q9HD90 331 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ERVK-11Q9UQG0 969 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 SCN2AQ99250 2005 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PRB8 838 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 TTLL8A6PVC2 850 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 SDHDO14521 159 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 DIAPH2O60879 1101 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 LRATO95237 230 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 CRYABP02511 175 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 CD96P40200 585 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 STX1BP61266 288 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 PRR5P85299 388 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 EBPQ15125 230 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1C1Q15619 314 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF628Q5EBL2 1059 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 FCRLBQ6BAA4 426 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A25Q6KCM7 469 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF615Q8N8J6 731 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 POGLUT1Q8NBL1 392 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJB8Q8NHS0 232 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5P2Q8WZ92 322 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 TESCQ96BS2 214 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 COQ8BQ96D53 544 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 DTNBP1Q96EV8 351 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 AMDHD1Q96NU7 426 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 GAL3ST4Q96RP7 486 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 RASL10BQ96S79 203 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MFRPQ9BY79 579 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 PLA2G3Q9NZ20 509 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM33Q9UPN9 1127 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 LOC400499M0QZD8 3231 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 SPTA1P02549 2419 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 PCSK5Q92824 1860 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 IGSF10Q6WRI0 2623 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA8OA6NCC3 632 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA8NF8WBI6 632 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 K7EM74 188 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 WWP2O00308 870 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 TP53I11O14683 189 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 UBDO15205 165 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2J2O76002 312 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 RASAL1O95294 804 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms