RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487036.1

FAM208A-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member A, human

TSL 3

Gene FAM208A, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF699	Q32M78	642 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	MUC21	Q5SSG8	566 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	DOK6	Q6PKX4	331 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ASRGL1	Q7L266	308 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SYVN1	Q86TM6	617 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RPAIN	Q86UA6	219 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	PHYHIP	Q92561	330 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	IWS1	Q96ST2	819 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	LRRC61	Q9BV99	259 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	NT5DC2	Q9H857	520 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036		Q9HAA7	133 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SPATA2	Q9UM82	520 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF175	Q9Y473	711 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036		A0A0A6YYD4	124 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TXNL1	O43396	289 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	PI15	O43692	258 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SSX5	O60225	188 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TRIM16	O95361	564 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SEMA4F	O95754	770 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TRIM49	P0CI25	452 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TRIM49C	P0CI26	452 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	DNAJB1	P25685	340 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	MAGEA4	P43358	317 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ASMT	P46597	345 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SGSH	P51688	502 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF131	P52739	623 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	GMFB	P60983	142 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	LMO4	P61968	165 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	HTD2	P86397	168 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CDKL1	Q00532	357 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CD300C	Q08708	224 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SNX1	Q13596	522 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ENPP2	Q13822	863 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	IL23R	Q5VWK5	629 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	IRGC	Q6NXR0	463 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	OLFM4	Q6UX06	510 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	PHC2	Q8IXK0	858 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	BANP	Q8N9N5	519 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	NTNG2	Q96CW9	530 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CCDC51	Q96ER9	411 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF597	Q96LX8	424 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	AGAP3	Q96P47	875 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	STRADB	Q9C0K7	418 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	HPF1	Q9NWY4	346 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CACNA1F	O60840	1977 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ASB14	A6NK59	587 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036		A8MXK9	166 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	BUB1	O43683	1085 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	STK17B	O94768	372 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	AKR7A3	O95154	331 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RNF224	P0DH78	156 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	LMO2	P25791	158 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TMOD1	P28289	359 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CCND2	P30279	289 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	PAX8	Q06710	450 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2

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