RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 PITPNM1O00562 1244 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CH25HO95992 272 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 IFNW1P05000 195 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 IL1RNP18510 177 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CXCL3P19876 107 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 NTRK2Q16620 822 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 GPRC6AQ5T6X5 926 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 FRG2Q64ET8 278 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZVL8 140 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CPA6Q8N4T0 437 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 NEIL3Q8TAT5 605 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 LRR1Q96L50 414 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 FRG2BQ96QU4 278 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CSF2RAP15509 400 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 GPX2P18283 190 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 EPORP19235 508 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 PTNP21246 168 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 PTSQ03393 145 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 MFSD13AQ14CX5 517 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 TIGD3Q6B0B8 471 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CRIPAKQ8N1N5 446 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 SLC9A6Q92581 669 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 LEFTY2O00292 366 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 YY2O15391 372 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 C8AP07357 584 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 PTPN6P29350 595 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 ERVFC1P60507 584 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 GAB1Q13480 694 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CLVS2Q5SYC1 327 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 TPGS2Q68CL5 300 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CACUL1Q86Y37 369 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 OR11H4Q8NGC9 324 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 BRD9Q9H8M2 597 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 SPG21Q9NZD8 308 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 MAB21L2Q9Y586 359 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 NUMA1Q14980 2115 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 PROM1O43490 865 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 MPZL2O60487 215 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 HCN1O60741 890 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 PREPP48147 710 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 ATP12AP54707 1039 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 TSPAN5P62079 268 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 PPP3R1P63098 170 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 B4GALNT1Q00973 533 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 HSF2Q03933 536 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 GCNT6Q5T4J0 391 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 HSDL2Q6YN16 418 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM46Q7Z4K8 759 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35A5Q9BS91 424 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 BRD7Q9NPI1 651 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PPL8 197 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM202A6NGA9 273 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 GREM1O60565 184 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 GATBO75879 557 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CFDP00746 253 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 IL1AP01583 271 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 MSL3P1P0C860 447 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CDK6Q00534 326 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 C17orf107Q6ZR85 190 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 UFD1Q92890 307 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 USP7Q93009 1102 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 SGTBQ96EQ0 304 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 PIGUQ9H490 435 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 SLC32A1Q9H598 525 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC88CQ9P219 2028 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 RGS11O94810 467 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf47O95873 294 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 ETV5P41161 510 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 NSG1P42857 185 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 ETV1P50549 477 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-204ENST00000483092 CLDN20P56880 219 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms