RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CSF2P04141 144 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 BCHEP06276 602 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FHP07954 510 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CHRM4P08173 479 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 THEGLP0DJG4 465 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 NR2F6P10588 404 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ETS2P15036 469 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RHCEP18577 417 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TTKP33981 857 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SOAT1P35610 550 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GGT2P36268 569 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR1E2P47887 323 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FASLGP48023 281 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MASP1P48740 699 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ALDH9A1P49189 494 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PRIM2P49643 509 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 KHKP50053 298 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 NUP107P57740 925 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RAB8AP61006 207 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1CAP62136 330 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 NPRL3Q12980 569 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HSPB3Q12988 150 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TUBA3CQ13748 450 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 KRT33BQ14525 404 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RAB39AQ14964 217 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SEC23BQ15437 767 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 NPTX1Q15818 432 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SYPL1Q16563 259 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MICAQ29983 383 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MANEAQ5SRI9 462 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ADCK2Q7Z695 626 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PARGQ86W56 976 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LACC1Q8IV20 430 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SPARTQ8N0X7 666 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR2L13Q8N349 312 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CADM4Q8NFZ8 388 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RHOXF1Q8NHV9 184 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GIPC3Q8TF64 312 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RAB8BQ92930 207 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SDCCAG3Q96C92 435 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ELP4Q96EB1 424 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TPD52L3Q96J77 140 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35G5Q96KT7 338 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLC6A18Q96N87 628 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SERINC2Q96SA4 455 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CSF3RQ99062 836 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TSC22D3Q99576 134 aa5.31□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 BTBD2Q9BX70 525 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GPR174Q9BXC1 333 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GSDMCQ9BYG8 508 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ROGDIQ9GZN7 287 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLC38A1Q9H2H9 487 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR51I1Q9H343 314 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 EXD2Q9NVH0 621 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM9Q9P0T7 183 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PHF11Q9UIL8 331 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 DAPP1Q9UN19 280 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CDC14AQ9UNH5 594 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 KCNE3Q9Y6H6 103 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SCN2AQ99250 2005 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 BDP1A6H8Y1 2624 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SPTBP11277 2137 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A0G2JPF8 293 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 ZAR1LA6NP61 321 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf74A8MZ97 194 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 H3BMH7 237 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF11BO00300 401 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SYT5O00445 386 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 DLL1O00548 723 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GNGT2O14610 69 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ZW10O43264 779 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 EMC8O43402 210 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FOXS1O43638 330 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TPST2O60704 377 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
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